Es gibt verschiedene Möglichkeiten unter Linux PDF Dateien zusammenfassen. Zum einen kann man es mit dem Programm
ImageMagick erledigen. Eigentlich ist ImageMagick zum umwandeln von Bilder in unterschiedliche Formate gedacht. Deshalb muss die Input Dateien auch keine PDF Dateien sein, sondern kann auch ein Bild sein.
convert DateiA.pdf DateiB.pdf Ergebnis.pdf
Auch mit dem Programm
Pdftk kann man das gleicher Ergebnis erziehen. Pdftk kann aber noch viel mehr mit dem PDF machen, es unterstützt auch Formulare, Verschlüsslung, Metadaten und noch vieles
mehr.
pdftk DateiA.pdf DateiB.pdf cat output Ergebnis.pdf
Eine Weiter Moeglichkeit ist es das PDF mit LaTeX und
PdfPages zu erstellen. Danach das LaTeX Dokument mit pdflatex übersetzten. Mit dieser Lösung kann man auch noch ein Inhaltsverzeichnis erzeugen und auch die MetaDaten mit angeben wie z.B. Autor, Betreff, Zusammenfassung, Schlüsselwörter.
\documentclass[a4paper,bookmarks=true]{book}
\usepackage{pdfpages}
\usepackage{hyperref}
\begin{document}
\pdfbookmark[1]{DateiA}{DateiA}
\includepdf{DateiA.pdf}
\pdfbookmark[1]{DateiB}{DateiB}
\includepdf{DateiB.pdf}
\end{document}
Bei meinen Test habe ich festgestellt, dass mit LaTeX die kleinsten Dateien erstellt werden. An der Qualität des PDF konnte ich zwischen den drei Lösungen keinen Unterschied feststellen.